発表リスト　(2022年度)


  1. ○Mitsuo Shoji, Unique reaction mechanism of copper amine oxidase revealed by theoretical QM/MM and experimental approaches, CCS-KISTI workshop, oral, CCS, U.Tsukuba, 2023/2/22.

  2. ○庄司光男, 酵素反応のQM/MM解析、スーパーコンピュータワークショップ2022「複雑電子状態の理論・計算科学」, 2023/1/17, ポスター, on-line.

  3. ○Mitsuo Shoji, A Large Conformational Change of the Quinone Cofactor in Bacterial Copper Amine Oxidase, ICPAC Kota Kinabalu 2022, 2022/11/25, oral (on line, invited).

  4. ○庄司光男, 酵素反応における構造変化の重要性, 令和４年度新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム, 淡路夢舞台国際会議場, 2022/11/21, 口頭発表（招待）.

  5. ○庄司光男, アミノ酸ホモキラリティ起源についての電子状態探査, 計算アストロバイオロジー2022, CCS, 口頭発表（招待）, 2022/11/10.

  6. ○Mitsuo Shoji, QM/MM-MD study of the role of valine 185 in the oxygen-evolving complex of photosystem II, 60th Annual Meeting of BSJ, on line, oral(invited), 2022/9/30.

  7. ○Mitsuo Shoji, Natural selection of the Mn cluster in the photosynthetic water oxidation , Satellite Meeting to 18th International Congress on Photosynthesis Research (WOX-ICPR2022), University of Otago, Dunedin, New Zealand, on line, oral(invited), 2022/8/7.

  8. ○M.Shoji, K.Miyagawa, H.Isobe, Y.Shigeta, K.Yamaguchi, QM/MM study of the role of valine 185 in the oxygen-evolving center of photosystem II, 18th International Congress on Photosynthesis Research (ICPR2022), Dunedin, New Zealand, on line, poster, 2022/8/4.

  9. ○庄司光男、GLASアルゴリズムによる酵素反応機構の理論解明：新規反応経路探索手法の開発と適用、物性研短期研究会「理論タンパク質物性科学の最前線：理論と実験との密な協働」、東大物性研、2022/7/27,口頭発表（招待）.

  10. ○庄司光男, “銅含有アミン酸化酵素におけるトパキノン補酵素の構造変化機構”, 第22回日本蛋白質科学会年会, つくば国際会議場, 2022/6/8, 招待講演.

  11. ○三嶋 謙二, 梅名 泰史, Mauro Boero, 重田 育照, 庄司 光男、光合成励起電子エネルギー移動効率とフィコビリソーム構造周期性との相関関係、量子生命科学会第４回大会、神戸大学、2022/5/27,ポスター発表.

  12. ○渡辺 七都稀、庄司 光男、堀 優太、重田 育照、アミノ酸ホモキラリティ起源を紐解く結晶形成過程についての量子化学研究、量子生命科学会第４回大会、神戸大学、2022/5/27、ポスター発表（優秀ポスター賞受賞）.

  13. ○庄司光男、宮川晃一、三嶋謙二、堀優太、重田育照、光合成水分解酸素発生におけるMnの自然選択の理由、量子生命科学会第４回大会、神戸大学, 2022/5/26, 口頭発表（優秀講演賞受賞）.

  14. ○Mitsuo Shoji, Theoretical insights into the molecular mechanisms of dynamical biochemical reactions, Molecular Movies International Symposium 2022, Riken Yokohama, oral+poster, 2022/5/13.


発表論文


  1. M.Shoji*, K.Kitazawa, A.Sato, N.Watanabe, M.Boero, Y.Shigeta, M.Umemura, Enantiomeric Excesses of Aminonitrile Precursors Determine the Homochirality of Amino Acids, The Journal of Physical Chemistry Letters, 14(13), 3243-3248, 2023. open access, DOI:/10.1021/acs.jpclett.2c03862

  2. K.Mishima*, M.Shoji*, Y.Umena, Y.Shigeta ,Biological advantage of the arrangements of C-phycocyanin chromophores in phycobilisome from the electronic energy transfer viewpoint, Bulletin of the Chemical Society of Japan, 96(4), 381-393, 2023. open access, DOI:/10.1246/bcsj.20220334

  3. M.Hashimoto, K.Miyagawa, M.Singh, K.Katayama, M.Shoji*, Y.Furutani, Y.Shigeta and H.Kandori*, Specific zinc binding to heliorhodopsin, Physical Chemistry Chemical Physics, 25, 3535-3543, 2023, DOI:/10.1039/D2CP04718G

  4. M.Shoji*, T.Murakawa, S.Nakanishi, M.Boero, Y.Shigeta, H.Hayashi and T.Okajima, Molecular mechanism of a large conformational change of the quinone cofactor in the semiquinone intermediate of bacterial copper amine oxidase, Chemical Science, 13(36), 10923-10938, 2022, open access, DOI: 10.1039/D2SC01356H

  5. M.Shoji*, N.Watanabe, Y.Hori, K.Furuya, M.Umemura, M.Boero, Y.Shigeta, Comprehensive Search of Stable Isomers of Alanine and Alanine Precursors in Prebiotic Syntheses, Astrobiology 22(9), 1129-1142, 2022, open access, DOI: 10.1089/ast.2022.0011 .

  6. S.Nagatomo*, M.Shoji, T.Terada, K.Nakatani, Y.Shigeta, S.Hirota, S.Yanagisawa, M.Kubo, T.Kitagawa, M.Nagai, M.Ohki,S.-Y.Park, N.Shibayama, Heme-bound tyrosine vibrations in hemoglobin M: Resonance Raman, crystallography, and DFT calculation, Biophysical Journal, 121(14), 2767-2780, 2022, https://doi.org/10.1016/j.bpj.2022.06.012




その他(発表, 出版, 行事等)


  1. 庄司光男, プレスリリース アミノ酸のホモキラリティ獲得の分子機構を解明〜量子化学計算で生命の起源を探る〜 (筑波大、CCS、日経新聞), 2023/3/30.

  2. 庄司光男, 銅含有アミン酸化酵素における非古典的酵素反応機構、理論化学会誌フロンティア, 17(5), 29-34 (2023), published 2023/1/31.

  3. 庄司光男, さきがけ最終領域会議 (ポスター, 口頭発表), 2023/1/25-27.

  4. 世話人：梅村雅之、矢島秀伸 (Chair)、福島肇、重田育照、庄司光男、堀優太、高橋淳一、計算アストロバイオロジー2022開催, CCS (WorkShopRoom), 2022/11/10-11.

  5. 庄司光男, 光合成水分解酸素発生の多階層連結シミュレーションによる学理解明(hp210115), HPCI利用研究課題の成果の報告・公開 (on line, poster), 2022/10/28.

  6. 庄司光男, さきがけ領域会議, ３期生発表会(後半, 口頭発表), 2022/10/24.

  7. Mitsuo Shoji, Large-scale electronic structure calculations for biomolecules, MRCP2021, CCS (oral, poster), 2022/10/14.

  8. 庄司光男, さきがけ領域会議, ３期生発表会(前半), 2021/10/3.