発表リスト　(2018)

  1. ○Mitsuo Shoji, "A new approach for searching reaction pathways applicable to quantum mechanical calculations", 2018/12/4, CCS-EPCC Joint Workshop, Edinburgh Parallel Computing Centre (EPCC), University of Edinburgh (Oral).

  2. ○庄司光男、村川武志、重田育照、岡島俊英、"銅含有アミン酸化酵素におけるセミキノンラジカル生成機構についての理論的解明"、2018/11/30、第32回分子シミュレーション討論会、産業技術総合研究所、つくば、茨城（ポスター）。

  3. ○山崎笙太朗、宮川晃一、木間塚政人、庄司光男、原田隆平、重田育照、堂野主税、中谷和彦、"DNA-小分子複合体の構造安定性"、2018/11/29、第32回分子シミュレーション討論会、産業技術総合研究所、つくば、茨城（ポスター）。

  4. ○常盤恭樹、庄司光男、柴田直樹、樋口芳樹、片岡邦重、重田育照、美齊津文典、"QM/MM法によるビリルビンオキシダーゼの三核銅中心における構造変化に関する理論的研究"、2018/11/29、第32回分子シミュレーション討論会、産業技術総合研究所、つくば、茨城（ポスター）。

  5. ○M.Shoji, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, K.Yamaguchi,"Water insertion reactions in the oxygen-evolving complex of photosystem II revealed by QM/MM calculations" 2018/10/31, ICPAC Langkawi 2018, Langkawi Island, Malaysia (oral invited).

  6. ○M.Shoji, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, K.Yamaguchi,"QM/MM study on the O2 formation and O2 release mechanism in the oxygen-evolving complex of photosystem II" 2018/9/16, the 56th Annual Meeting of The BioPhysical Society of Japan, Okayama University, Okayama (oral).

  7. ○M.Shoji, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, K.Yamaguchi,"QM/MM study on the S state transitions of the oxygen-evolving complex in photosystem II" 2018/8/3, the 43rd International Conference on Coordination Chemistry (ICCC2018), Sendai, Miyagi (oral invited).

  8. ○庄司光男、分子構造および反応機構探索アルゴリズムの新展開、第18回日本蛋白質科学会年会、2018/6/26、新潟、新潟（ポスター）。

  9. ○M.Shoji, M.Kayanuma, Y.Shigeta, “A new algorithm searching stable molecular structures and reaction pathways by introducing repulsive interactions among walkers” 2018/6/20, ICQC 2018, Menton, France (Poster).

  10. ○M.Shoji, M.Kayanuma, H.Kitoh-Nishioka, Y.Shigeta, "A new approach for searching stable molecular structures by introducing repulsive interactions among walkers", 7thJCS, 2018/5/21-24, Prague, Czech Republic (Poster).

  11. ○庄司光男、常盤恭樹、山崎笙太朗、栢沼愛、重田育照、"分子構造探索および反応経路探索のための新手法(GLAS 法)の提唱"、2018/5/16、第２１回理論化学討論会、岡崎カンファレンスセンター、岡崎 (口頭)。

  12. ○M.Shoji et al., ”QM/MM study on the S4 -> S0 transition of the Oxygen-Evolving Complex in Photosystem II”, 2018/3/20-22, 5th IWSES, Nanyang Techonology University, Singapore (Poster).

  13. ○山崎笙太朗ら、“QM/MM法によるシアン耐性酸化酵素の酸素結合様式についての理論的解析”、2018/3/13-14、日本生物物理学会東京支部会、東京大学、駒場、東京 (口頭)。

  14. ○常盤恭樹ら、“QM/MM法によるビリルリンオキシダーゼにおける構造変化と酸化還元電位に関する理論的研究” 、2018/3/13-14、日本生物物理学会東京支部会、東京大学、駒場、東京 (口頭)。

  15. ○庄司光男ら、”新規分子構造探索アルゴリズム(GLAS法)の提案”　、2018/3/13-14、日本生物物理学会東京支部会、東京大学、駒場、東京 (口頭)。




発表論文


  1. T. Tokiwa*, M. Shoji*, V. Sladek, N. Shibata, Y. Higuchi, K. Kataoka, T. Sakurai, Y. Shigeta, F. Misaizu, Structural Changes of the Trinuclear Copper Center in Bilirubin Oxidase upon Reduction, molecules, 24(1), 76-87, 2019. DOI:10.3390/molecules24010076

  2. M.Shoji*, M.Kayanuma, Y.Shigeta, A practical approach for searching stable molecular structures by introducing repulsive interactions among walkers, The Bulletin of the Chemical Society of Japan, 191(10), 1465-1473 (selected paper). DOI:10.1246/bcsj.20180122

  3. M.Shoji*, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, K.Yamaguchi*, Concerted mechanism of water insertion and O2 release during the S4 to S0 transition of the oxygen-evolving complex in photosytem II, The Journal of Physical Chemistry B, 122 (25), pp 6491-6502 (2018). DOI:10.1021/acs.jpcb.8b03465

  4. M.Shoji*, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, K.Yamaguchi*, Nonadiabatic one-electron transfer mechanism for the O-O bond formation in the oxygen-evolving complex of photosystem II, Chemical Physics Letters, 698, 138-146 (2018). DOI:10.1016/j.cplett.2018.02.056

  5. A.Sato*, Y.Kitazawa, T.Ochi, M.Shoji*, Y.Komatsu, M.Kayanuma, Y.Aikawa, M. Umemura, Y.Shigeta, First-principles study of the formation of glycine-producing radicals from common interstellar species, Molecular Astrophysics, 10, 11-19 (2018). DOI:10.1016/j.molap.2018.01.002




その他(発表、出版、行事等)


  1. 庄司光男, ｢特集光化学系II酸素発生中心にあたって｣,2018/10/16,アンサンブル, 40(4), 222,2018.

  2. 庄司光男, ｢光化学系II酸素発生中心の反応機構｣,2018/10/16,アンサンブル, 40(4), 238-242,2018.

  3. Mitsuo Shoji, 2018/10/16, Large scale molecular simulations for the elucidation of biomolecular structural changes and catalytic reaction mechanisms, CCS international symposium 2018, Tsukuba (Poster+1min. Talk).

  4. Mitsuo Shoji, 2018/10/6-9, STS forum Annual Meeting 2018, Kyoto International Conference Center, Kyoto.

  5. 庄司光男、反応機構の理論解明, 2018/9/1, 新学術領域研究 革新的光物質変換 ニュースレター　 第1巻 第9号 。

  6. M.Shoji, Quantum Chemistry Approaches to Elucidate Chemical Reactions in Astrobiology, 2018/8/29, Space Science Colloquium #130, JAXA Sagamihara campus, Sagamihara, Kanagawa (oral, invited).

  7. 庄司光男、光化学系II酸素発生中心でのS3→S0反応機構、2018/6/23, 新学術「革新的光物質変換」第1回合同班会議, 伊東、静岡（口頭）。

  8. 庄司光男, 磯部寛, 重田育照, 中嶋隆人, 山口兆,「光合成における酸素発生の反応機構」,生物物理, 58(3), 127-133 (2018). (解説) DOI:10.2142/biophys.58.127 .