発表リスト　(2016)

  1. 氏家謙、○庄司光男、原田隆平、村川武志、重田育照、林秀行、レオニン合成酵素における生成物支援機構の理論的解明、第５４回生物物理会年会, 筑波国際会議場、2016/11/25-27（ポスター）。

  2. ○庄司光男、光合成酸素発生中心の電子・スピン状態の理論解析,第55回電子スピンサイエンス学会年会（SEST2016), 大阪市立大学, 2016/11/11（招待講演）。

  3. ○庄司光男、磯部寛、山口兆、光化学系II酸素発生中心(PSII-OEC)におけるS2-S3状態変化についての理論的研究、第８９回日本生化学学会大会、東北大学, 2016/9/26,（ポスター）。

  4. Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Kizashi Yamaguchi, Reaction mechanisms of the S2 to S3 transition in the oxygen-evolving complex of photosytem II, the 17th International Congress on Photosynthesis Research, Maastricht, The Netherlands, 2016/8/7-12 (poster).

  5. Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi, Yasuteru Shigeta, Yu Takano, Electronic structures of the synthetic model of the photosynthetic oxygen-evolving complex, VUVX satellite workshop, University of Zurich, Zurich, Switzerland, 2016/7/1 (poster, invited).

  6. Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Kizashi Yamaguchi, Reaction mechanisms for the S2 to S3 transition in the oxygen-evolving complex of photosystem II, AWEST 2016, Awaji island, Hyogo, 2016/6/19-21 (oral, invited).

  7. Akimasa Sato, Mitsuo Shoji, Yuya Kitazawa, Toshiro Ochi, Masayuki Umemura, Yasuteru Shigeta, The formation of interstellar glycine by radical-coupling reactions, AWEST 2016, Awaji island, Hyogo, 2016/6/19-21 (poster).

  8. 佐藤皓允,星間空間における円偏光吸収反応によるL型アミノ酸過剰生成の計算科学的検証, 宇宙生命計算科学連携拠点第２回ワークショップ, 筑波大学計算科学研究センター, 2016/4/28 (口頭).
  9. 庄司光男,星間ダスト上でのアミノ酸生成反応機構についての理論的研究, 宇宙生命計算科学連携拠点第２回ワークショップ, 筑波大学計算科学研究センター, 2016/4/28 (口頭).

  10. Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Kizashi Yamaguchi, Large-Scale QM/MM study on the oxygen-evolving complex of photosytem II, 79th Harden Conference: Oxygen Evolution and Reduction - Common Principles, Innsbruck, Austria, ,2016/4/16-20 (poster).

  11. Mitso Shoji, Hiroshi Isobe, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi, Electronic structure analysis on the synthetic model (Mn4CaO4) of the photosynthetic oxygen evolving complex、Annual Meeting of the Chemical Society of Japan, 2016/3/27（口頭発表）.

  12. 庄司光男、宇宙空間でのアミノ酸生成反応機構についての理論的研究、日本天文学会 2016 年春季年会, 首都大学東京、2016/3/15（口頭発表）.

  13. 庄司光男、NTChemによる光合成酸素発生中心の電子状態解析 , 第五回NTChemワークショップ、秋葉原UDX6階カンファレンス、2016/3/9（口頭発表,招待）.

  14. 庄司光男、分割統治法を用いた初期電子密度行列の効率的作成、蛋白質研セミナー,東大先端研、2016/3/1-2（ショートトーク＋ポスター）.

  15. Mitsuo Shoji、Possibilities of Glycine formation in interstellar medium, Symposium on Hierarchy and Holism in Natural Sciences, National Astronomical Observatory of Japan, oral(invited),2016/2/5.



発表論文


  1. M. Shoji, H. Isobe, T. Nakajima, K. Yamaguchi, Large-scale QM/MM calculations of the CaMn4O5 cluster in the oxygen-evolving complex of photosystem II: comparisons with EXAFS structures, Chem. Phys. Lett., 658, 354-363 (2016), DOI:10.1016/j.cplett.2016.06.067

  2. W. Tanaka, M. Shoji, F. Tomoike, Y. Ujiie, K. Hanaoka, R. Harada, M. Kayanuma, K. Kamiya, T. Ishida, R. Masui, S. Kuramitsu, Y. Shigeta, Molecular Mechanisms of Substrate Specificities of Uridine-Cytidine Kinase, Biophysics and Physicobiology, 13, 77-84 (2016), DOI:10.2142/biophysico.13.0_77

  3. M. Kayanuma, M. Shoji, M. Yohda, M. Odaka, Y. Shigeta, Catalytic Mechanism of Nitrile Hydratase Subsequent to Cyclic Intermediate Formation: A QM/MM Study, J. Phys. Chem. B 123 (13), 3259-3266 (2016), DOI: 10.1021/acs.jpcb.5b11363.

  4. M. Shoji, H. Isobe, J.-R. Shen, K. Yamaguchi, Geometric and electronic structures of the synthetic Mn4CaO4 model compound mimicking the photosynthetic oxygen-evolving complex, Physical Chemistry Chemical Physics, 18, 11330-11340 (2016), DOI: 10.1039/C5CP07226C.




その他(発表、出版、行事等)


  1. 庄司光男、計算科学シミュレーションによる生体システムの理論的解明、第8回「学際計算科学による新たな知の発見・統合・創出」シンポジウム、筑波大学,2016/10/17（フラッシュトーク、ポスター）。
  2. 庄司光男、光化学系II酸素発生中心の反応機構についての理論的研究 、OCARINAセミナー、大阪市立大学、2016/9/2（招待講演）.
  3. 庄司光男、シミュレーションによる生命物理学 、筑波大学計算科学研究センター 一般公開、2016/4/23（口頭発表）.
  4. 送別会(栢沼先生、坂本君、木立さん) 、筑波大学計算科学研究センター、2016/3/18.
  5. 庄司光男、大規模分子シミュレーションによる生命現象の解明, 年次報告会、筑波大学計算科学研究センター、2016/2/24（口頭発表）.
  6. 山本芳嗣先生送別会,筑泳会, le scarecrow, 2016/2/12.
  7. 北浦和夫先生 神戸大学退職お祝い会
  8. 北浦和夫先生との共同研究打ち合わせ、神戸理研計算科学研究機構, 2016/2/9.
  9. 梅田宏明さん送別会、エルベ(つくば西部)、2016/2/1.