発表リスト (2012)



第85回日本生化学会大会@福岡国際会議場, 2012/12/16.
[23]○ 田口 真彦, 小松 勇, 佐藤 皓允, 蘇 垠成, 庄司 光男, 栢沼 愛, 神谷 克政, 梅村 雅之, 矢花 一浩, 白石 賢二、光合成光捕集複合体IIにおける光励起状態についての理論的研究、ポスター。
[22]○ 花岡 恭平, 庄司 光男, 近藤 大生, 田口 真彦, 栢沼 愛, 神谷 克政, 白石 賢二、アゴニスト結合型ビタミンD受容体の溶液中のダイナミクスと活性制御機構、ポスター。
[21]○ 近藤 大生, 花岡 恭平, 田口 真彦, 神谷 克政, 庄司 光男, 河合(野間) 繁子, 田口 英樹, 白石 賢二、Q/Nに富んだペプチドがつくるアミロイド線維の構造安定化機構の理論的解析、ポスター。
[20]○ 庄司 光男, 花岡 恭平, 近藤 大生, 田口 真彦, 栢沼 愛, 梅田 宏明, 鴨志田 良和, 神谷 克政, 白石 賢二, 村川 武志, 林 秀行,トレオニン合成酵素におけるリン酸脱離以降の反応機構についての理論的解明、ポスター。


第35回日本分子生物学会年会@福岡国際会議場、2012/12/11.
[19]○ 花岡 恭平, 庄司 光男, 近藤 大生, 田口 真彦, 栢沼 愛, 神谷 克政, 白石 賢二,アゴニスト結合型ビタミンD受容体のマイナーコンフォメーション、ポスター。
[18]○ 田口 真彦, 小松 勇, 佐藤 皓允, 蘇 垠成, 庄司 光男, 栢沼 愛, 神谷 克政, 梅村 雅之, 矢花 一浩, 白石 賢二、光合成光化学系IIにおけるアンテナ部の光捕集機構についての理論的研究、ポスター。


第3回協定講座シンポジウム@神戸大学統合研究拠点、2012/11/29
[17]○ 庄司光男、花岡恭平、近藤大生、梅田宏明、神谷克政、白石賢二, 一酸化窒素還元酵素におけるN2O生成機構についての理論的研究、ポスター。
[16]○ 花岡恭平、庄司光男、近藤大生、ヤンムンヨン、神谷克政、白石賢二, QM/MM法によるII型DNAトポイソメラーゼのDNA再結合反応の解明、ポスター。
[15]○ 近藤大生、花岡恭平、田口真彦、神谷克政、庄司光男、河合-野間繁子、田口英樹、白石賢二,Q/Nに富んだペプチドがつくるアミロイド線維の構造安定化機構の計算科学的解析、ポスター。
[14]○ 田口真彦、小松勇、佐藤皓允、蘇垠成、庄司光男、栢沼愛、神谷克政、梅村雅之、矢花一浩、白石賢二,光合成アンテナ部の光捕集機構についての理論的研究とそれを用いた系外惑星における生命指標検出に向けての検討、ポスター。

第5回アストロバイオロジーワークショップ 2012/11/23,24.
[13]○ 田口真彦、小松勇、佐藤皓允、蘇垠成、庄司光男、栢沼愛、神谷克政、梅村雅之、矢花一浩、白石賢二,系外惑星における生命指標としての光合成色素についての理論的研究、口頭。
[12]○ 小松勇, 梅村雅之, 庄司光男, 矢花一浩, 白石賢二, 神谷克政, 栢沼愛, 田口真彦, 佐藤皓允, 蘇垠成,系外惑星のバイオマーカー検出に向けた光合成アンテナ機構の励起状態計算、口頭。

[11]○ Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Kizashi Yamaguchi, Jian-Ren Shen, Ground spin state of the oxygen-evolving complex at the S2 state, Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems 10/22 @ Okayama, poster.

[10]○ Kyohei Hanaoka, Mitsuo Shoji, Daiki Kondo, Akimasa Sato, Moon Young Yang, Katsumasa Kamiya, and Kenji Shiraishi, QM/MM simulation revealed a substrate mediated proton relay mechanism in DNA religation reaction catalyzed by Type II DNA topoisomerase, CCP2012@Kobe, 10/13, poster.

[9]○ Mitsuo Shoji, Kyohei Hanaoka, Daiki Kondo, Hiroaki Umeda, Megumi Kayanuma, Katsumasa Kamiya, Kenji Shiraishi, Shogo Nakano, Katsuo Katayanagi, QM/MM 法による同化型亜硝酸還 元酵素の反応機構についての理論的研究, 第50回日本生物物理学会年会、2012/9/22@名大,ポスター。

[8]○ 花岡 恭平・近藤 大生・庄司 光男・梁 文榮・神谷 克政・白石 賢二 II 型 DNA トポ イソメラーセによる DNA 再結合反応に対する基質を介するプロトンリレー機構、第6 回バイオ関連化学合同シンポジウム@北大, 2012/9/6。

[7]○ 佐藤 皓允、田口真彦、第7回夏の学校 宇宙ライフサイエンス若手の会、2012/8/25, ポスター発表。

第12回日本蛋白質科学会年会、名古屋国際会議場、2012/6/20
[6]○ 花岡恭平、近藤大生、庄司光男、梁文榮、神谷克政、白石賢二、酵母DNAトポイソメラーゼ II における DNA 再結合反応の理論的解明、ポスター。
[5]○ 庄司光男、花岡恭平、近藤大生、梁 文榮、梅田宏明、神谷克政、白石賢二、一酸化窒素還元酵素(NOR)における N2O 生成酵素についての理論的研究、ポスター。

[4]○ Mitsuo Shoji, Kyohei Hanaoka, Daiki Kondo, Hiroaki Umeda, Katsumasa Kamiya, YasutakaKitagawa, Kenji Shiraishi, QM/MM study on the catalytic mechanism of nitrix oxide reductase,2012 ICQC - International Congress of Quantum Chemistry, June 25 - 30, 2012, Boulder, Colorado, poster.

[3]○ 佐藤、庄司、神谷、梅村、矢花、白石、” Theoretical Investigation of a Mechanism of Chirality Induction for Amino Acids in the Early Solar System”, 日本地球惑星科学連合大会, 口頭 5/24.

天文学会2012年春季年会@龍谷大学
[2] 佐藤 皓允、庄司光男、神谷克政、梅村雅之、矢花一浩、白石賢二, 星間空間における光誘起L型アミノ酸過剰の理論的研究, 2012/03/22, 口頭。

ALMAワークショップ@国立天文台
[1] 佐藤 皓允、庄司光男、神谷克政、梅村雅之、矢花一浩、白石賢二, 星間空間におけるアミノ酸キラリティ生成機構の理論的研究, 2012/01/21, 口頭。



発表論文





その他(発表、出版)


[7] 庄司光男、トレオニン合成酵素における反応制御機構の理論的解明,第4回拠点シンポシウム@秋葉原,2012/7/12.
[6]庄司光男、将来展望ワークショップ@大阪大学、2012/10/20.
[5]庄司光男、CCS 見学会(富山県立富山南高等学校) 2012/10/17.
[4] Mitsuo Shoji, Computational Bioscience Utilizing Supercomputers: Performance and Applications, INc8でのCCS-Tsukubaの紹介、CCS-Tsukuba, 2012/5/11.
[3] Mitsuo Shoji, Computational Bioscience Utilizing Supercomputers: Performance and Applications, LBNL and CCS-Tsukuba Joint Workshop, Tsukuba-CCS, 2012/3/19.
[2] 庄司、花岡、佐藤、第1回つくば科学研究コンテスト、審査員、2012/3/17.
[1] Mitsuo Shoji, QM/MM Studies on the reaction mechanisms in metalloenzymes, Exascale Symposium, The University of Edinburgh, 2012/2/23.