発表リスト　(2017)

  1. ○S.Yamasaki, M.Shoji, Y.Shigeta, "A QM/MM study on the oxygen-binding structures of alternative oxidase", CPMD2017, 2017/10/19, Tsukuba International Congress Center（Poster）.

  2. ○M.Kimazuka, Y Shigeta, M.Shoj, "Molecular Dynamics Studies on the effects of Anti-Freeze Protein (AFP) on ice growth", CPMD2017, 2017/10/19, Tsukuba International Congress Center（Poster）.

  3. ○T.Tokiwa, M.Shoji, N.Shibata, Y.Higuchi, K.Kataoka, Y.Shigeta, and F.Misaizu、"QM/MM Study on the T1 Cu site structures and the Redox Potentials in Bilirubin Oxidase (BOD)"、CPMD2017, 2017/10/19, Tsukuba International Congress Center（Poster）.

  4. ○M.Shoji, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, and K.Yamaguchi, "QM/MM study on a S4 -> S0 reaction of the Oxygen Evolving Complex in Photosystem II"、CPMD2017, 2017/10/19, Tsukuba International Congress Center（Poster）.

  5. ○M.Kimazuka, Y. Shigeta, M.Shoji,"Molecular Dynamics Studies on Anti-Freeze Protein (AFP) and Water Molecules", TGSW-IWP2017, 2017/9/26,　Tsukuba International Congress Center（Poster）.

  6. ○S.Yamasaki, M.Shoji, Y.Shigeta, "QM/MM study on the oxygen-binding structure of trypanosome alternative oxidase (TAO)", TGSW-IWP2017, 2017/9/26,　Tsukuba International Congress Center（Poster）.

  7. ○庄司光男、星間空間におけるアミノ酸生成と光不斉化についての量子化学的探究、天体形成論 ~過去・現在・未来~, 2017/9/21, 筑波大学大学会館、つくば(口頭、招待).

  8. ○M.Shoji, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, K.Yamaguchi, QM/MM study on the O2 release mechanism of the oxygen-evolving complex in photosystem II, 55th BSJ, 2017/9/20, Kumamoto Univ., Kumamoto (Oral).

  9. ○M.Shoji, S.Yamasaki, M.Kayanuma, Y.Shigeta, Reaction mechanisms of iron-containing proteins elucidated using QM/MM calculations, 55th BSJ, 2017/9/19, Kumamoto Univ., Kumamoto (Oral invited).

  10. ○M.Shoji, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, J.-R.Shen, K.Yamaguchi, Large-scale QM/MM study on the S1 state structures of the oxygen-evolving complex in photosystem II, JSCC67, 2017/9/18, Sapporo Hokkaido (Poster).

  11. ○木間塚政人、重田育照、庄司光男,「分子動力学法による不凍タンパク質と水分子間の相互作用に関する理論研究」, 第１１回分子科学討論会, 9/15-18, 東北大学川内北キャンパス (ポスター).

  12. ○山崎 笙太朗，庄司 光男， 重田 育照, 「シアン耐性酸化酵素における酸素分子結合構造についての理論的研究」,第１１回分子科学討論会,2017/9/17, 東北大学川内キャンパス（口頭）.

  13. ○常盤恭樹、庄司光男、柴田直樹、樋口芳樹、片岡邦重、重田育照、美齊津文典、"ビリルビンオキシダーゼの構造と酸化還元電位に関する理論的研究 (Theoretical study on the structural changes and redox potentials of bilirubin oxidase (BOD))", 第１１回分子科学討論会,2017/9/16, 東北大学川内北キャンパス,仙台市（口頭）.

  14. ○庄司光男、村川武志、岡島俊英、重田育照、”銅含有アミン酸化酵素における触媒反応中のプロトン化状態についての理論的解明”、第１７回日本蛋白質科学会年会,2017/6/22,仙台国際センター (ポスター).

  15. M. Shoji, ”A quantum chemical study of the glycine formation reactions in interstellar medium”, ABC workshop, 2017/3/21-23, Hiroshima (Oral).




発表論文


  1. M.Kayanuma, K.Kidachi, M.Shoji, Y.Komatsu, A.Sato, Y.Shigeta, Y.Aikawa, M. Umemura, A theoretical study of the formation of glycine via hydantoin intermediate in outer space environment, Chemical Physics Letters, 687(1), 178-183 (2017). DOI: 10.1016/j.cplett.2017.09.016

  2. Y.Ujiie, W.Tanaka, K.Hanaoka, R.Harada, M.Kayanuma, M.Shoji, T.Murakawa, T.Ishida, Y.Shigeta, H.Hayashi, Molecular Mechanism of the Reaction Specificity in Threonine Synthase: Importance of the Substrate Conformations, The Journal of Physical Chemistry B, 121(22), 5536-5543 (2017). DOI: 10.1021/acs.jpcb.7b02932

  3. Y.Abe, M.Shoji, Y.Nishiya, H.Aiba, T.Kishimoto, K.Kitaura, Reaction mechanism of sarcosine oxidase elucidated using FMO and QM/MM methods, Physical Chemistry Chemical Physics, 19, 9811-9822 (2017), DOI: 10.1039/C6CP08172J.




その他(発表、出版、行事等)


  1. 庄司光男、大規模分子シミュレーションによる生体システムの理論的解明、HPCI成果報告会、11/2、品川コクヨホール、ポスター。
  2. 庄司光男、研究室説明会、筑波大学オープンキャンパス、5/20.
  3. 庄司光男、「生命起源解明のためのアミノ酸生成と分解機構についての量子化学研究」、ポスト「京」 萌芽的課題・計算惑星第 1 回公開シンポジウム:惑星の起源・進化と環境変動の解明を目指して、 3/6、神戸大学、兵庫(口頭).
  4. 栢沼愛、「星間空間におけるアミノ酸生成反応の第一原理計算」、ポスト「京」萌芽的課題・計算惑 星第 1 回公開シンポジウム:惑星の起源・進化と環境変動の解明を目指して、3/6、神戸大学、兵 庫(口頭).